手动安装

1 通过Rstudio菜单安装

1.1 Tools--Install Pacakges...

1.2 Pacakges--Install

ggplot2

通过install.pacakges命令安装

install.packages('readxl')
install.packages('writexl')

通过BiocManager安装

手动选择镜像源

install.packages('BiocManager')  # 安装一次
options(BioC_mirror='https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/bioconductor') 
# 每次打开Rstudio均需要设置
BiocManager::install('DESeq2') # Update all/some/none? [a/s/n]: n

设置Rprofile.site

local({
  r = getOption('repos')
  options(repos = r, BioC_mirror='https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/bioconductor')
})

 

 

软件调用

library(ggplot2)
library(readxl)
library(DESeq2)

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书籍是良药也是毒药